تجزیه و تحلیل توالی مولکولی ژن ITS جهت شناسایی گونه‌های جداسازی شده جنس فوزاریم از مناطق مختلف ایران

سابقه و هدف: شناسایی و تمایز جنس فوزاریم در سطح گونه، برای مقاصد اپیدیمیولوژی و پاتولوژیکی ضروری است. هدف از این مطالعه بررسی روابط فیلوژنتیکی و یافتن الگو‌های تکراری کلاستر ‌شده مشخص در ناحیه ITS  به­منظور شناسایی گونه‌های متفاوت جنس فوزاریم است. مواد و روش‌ها: 16 جدایه از گونه‌های متفاوت جنس فوزاریم و از نواحی مختلف ایران جمع آوری شدند. ناحیه فاصله­انداز داخلی DNA ریبوزومی توسط واکنش زنجیره‌ای پلی­مراز تکثیر،  توالی­یابی و با ابزار‌های مختلف مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. یافته­ ها: محصول واکنش زنجیره‌ای پلی­مراز، قطعه­های به­طول به­طورتقریبی 550 جفت باز در تمام جدایه‌ها بود. مقایسه توالی‌ها و فیلوگرام حاصل از تجزیه و تحلیل ناحیه ITS، گونه‌های جنس فوزاریم را در ده گروه مختلف قرار داد. بحث: ناحیه فاصله­انداز داخلی بی­ثبات و تغییرپذیر هستند. سطح بالای تنوع بین ناحیه فاصله­انداز داخلی ناشی از حذف یا اضافه شدن واحدهای تکراری در ناحیه فوق است. نتیجه­ گیری: بعضی از جدایه‌ها به­طور قطعی شناسایی می‌شوند. بعضی از آن‌ها دارای الگوی متفاوتی هستند. وجود موتیف­های خوشه‌شده بی‌همتا در ناحیه ITS یک گونه خاص نشان می‌دهد که این موتیف‌ها می­توانند به­عنوان یک ابزار شناسایی گونه مورد نظر به‌کار‌ روند.